Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO3Q9UK99 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO3Q9UK99 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO3Q9UK99 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms