Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GGA1Q9UJY5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms