Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL4Q9UJQ4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms