Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPUSD1Q9UJJ7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms