Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX25Q9UHL0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms