Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLKQ9UBT6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.57■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.56■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.56■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.55■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.54■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLKQ9UBT6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms