Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NLKQ9UBE8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms