Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SAE1Q9UBE0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAE1Q9UBE0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms