Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD5

ORC3, Origin recognition complex subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC3Q9UBD5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ORC3Q9UBD5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ORC3Q9UBD5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms