Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMD4AQ9P2Q2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
FRMD4AQ9P2Q2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FRMD4AQ9P2Q2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FRMD4AQ9P2Q2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms