Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MSRB1Q9NZV6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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