Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EHD2Q9NZN4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EHD2Q9NZN4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms