Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM5

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP53Q9NZM5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NOP53Q9NZM5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NOP53Q9NZM5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms