Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK12Q9NYV4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK12Q9NYV4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms