Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL5

CYP39A1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP39A1Q9NYL5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYP39A1Q9NYL5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP39A1Q9NYL5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP39A1Q9NYL5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP39A1Q9NYL5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP39A1Q9NYL5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP39A1Q9NYL5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP39A1Q9NYL5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP39A1Q9NYL5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP39A1Q9NYL5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP39A1Q9NYL5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP39A1Q9NYL5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP39A1Q9NYL5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP39A1Q9NYL5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP39A1Q9NYL5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms