Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXC10Q9NYD6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC10Q9NYD6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms