Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FANCLQ9NW38 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms