Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms