Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG3Q9NT62 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG3Q9NT62 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms