Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT82Q9NSB4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT82Q9NSB4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms