Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SNX15Q9NRS6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX15Q9NRS6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms