Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DUOX1Q9NRD9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUOX1Q9NRD9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms