Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C8orf4Q9NR00 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
C8orf4Q9NR00 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms