Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPHNQ9NQX3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPHNQ9NQX3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms