Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
A4GALTQ9NPC4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
A4GALTQ9NPC4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms