Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms