Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C11orf49Q9H6J7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C11orf49Q9H6J7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms