Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMG9Q9H0W8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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