Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC8Q9H0W5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC8Q9H0W5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms