Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHARPINQ9H0F6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms