Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR2J2Q9GZM3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR2J2Q9GZM3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms