Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBE2OQ9C0C9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms