Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
KRTAP9-3Q9BYQ3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms