Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC3Q9BY71 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC3Q9BY71 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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