Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VN1R3Q9BXE9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VN1R3Q9BXE9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms