Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDCA7Q9BWT1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDCA7Q9BWT1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA7Q9BWT1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA7Q9BWT1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA7Q9BWT1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA7Q9BWT1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA7Q9BWT1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA7Q9BWT1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA7Q9BWT1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA7Q9BWT1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA7Q9BWT1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA7Q9BWT1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA7Q9BWT1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA7Q9BWT1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA7Q9BWT1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA7Q9BWT1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CDCA7Q9BWT1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDCA7Q9BWT1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDCA7Q9BWT1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms