Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM2Q9BVW6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMIM2Q9BVW6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMIM2Q9BVW6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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