Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB2BQ9BVA1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB2BQ9BVA1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms