Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3CQ9BUI4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3CQ9BUI4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms