Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RSG1Q9BU20 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms