Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF1Q9BSM1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms