Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV3

SLC50A1, Sugar transporter SWEET1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC50A1Q9BRV3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC50A1Q9BRV3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC50A1Q9BRV3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms