Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FYCO1Q9BQS8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms