Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LPIN3Q9BQK8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LPIN3Q9BQK8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms