Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PMCHL2Q9BQD1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms