Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOPXQ9BPY8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOPXQ9BPY8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOPXQ9BPY8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOPXQ9BPY8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOPXQ9BPY8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOPXQ9BPY8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOPXQ9BPY8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOPXQ9BPY8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOPXQ9BPY8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOPXQ9BPY8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOPXQ9BPY8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOPXQ9BPY8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOPXQ9BPY8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOPXQ9BPY8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOPXQ9BPY8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOPXQ9BPY8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOPXQ9BPY8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOPXQ9BPY8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOPXQ9BPY8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOPXQ9BPY8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOPXQ9BPY8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOPXQ9BPY8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOPXQ9BPY8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOPXQ9BPY8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOPXQ9BPY8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOPXQ9BPY8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOPXQ9BPY8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOPXQ9BPY8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOPXQ9BPY8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOPXQ9BPY8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOPXQ9BPY8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOPXQ9BPY8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms