Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT12Q99456 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT12Q99456 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms