Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
TCF12Q99081 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TCF12Q99081 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms