Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CITED4Q96RK1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms