Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TEFMQ96QE5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms